Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col9a2Q07643 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms