Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprgQ05909 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprgQ05909 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms