Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk18Q04899 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms