Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd1Q04519 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms