Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha4Q03137 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms