Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms