Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms