Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2cQ01098 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms