Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SeleQ00690 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms