Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga4Q00651 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms