Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf1P81269 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf1P81269 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf1P81269 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf1P81269 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms