Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otx1P80205 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otx1P80205 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms