Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms