Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp7P70280 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms