Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfixP70257 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfixP70257 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfixP70257 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NfixP70257 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfixP70257 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfixP70257 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfixP70257 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfixP70257 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfixP70257 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfixP70257 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfixP70257 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfixP70257 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NfixP70257 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfixP70257 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfixP70257 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfixP70257 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfixP70257 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfixP70257 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfixP70257 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfixP70257 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfixP70257 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfixP70257 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfixP70257 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfixP70257 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NfixP70257 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NfixP70257 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NfixP70257 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfixP70257 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms