Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig1P70193 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms