Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbdsP70122 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbdsP70122 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms