Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ufm1P61961 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms