Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rin3P59729 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms