Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps33bP59016 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms