Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms