Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms