Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bace1P56818 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bace1P56818 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace1P56818 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms