Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox7bP56393 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms