Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GferP56213 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GferP56213 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GferP56213 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GferP56213 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GferP56213 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GferP56213 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GferP56213 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GferP56213 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GferP56213 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GferP56213 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GferP56213 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GferP56213 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GferP56213 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GferP56213 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GferP56213 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GferP56213 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms