Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acod1P54987 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acod1P54987 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms