Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms