Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rad23aP54726 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad23aP54726 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms