Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Map3k1P53349 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms