Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp1P52624 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp1P52624 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms