Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx3P50481 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx3P50481 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx3P50481 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lhx3P50481 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lhx3P50481 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lhx3P50481 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms