Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SftpdP50404 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SftpdP50404 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms