Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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