Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf4P43488 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms