Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd1P40201 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd1P40201 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd1P40201 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd1P40201 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd1P40201 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd1P40201 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Chd1P40201 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd1P40201 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd1P40201 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Chd1P40201 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd1P40201 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chd1P40201 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1P40201 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Chd1P40201 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1P40201 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1P40201 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1P40201 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1P40201 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1P40201 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1P40201 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1P40201 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1P40201 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd1P40201 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Chd1P40201 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Chd1P40201 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Chd1P40201 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Chd1P40201 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd1P40201 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Chd1P40201 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd1P40201 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1P40201 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1P40201 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1P40201 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Chd1P40201 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1P40201 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1P40201 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1P40201 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1P40201 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1P40201 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Chd1P40201 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd1P40201 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd1P40201 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Chd1P40201 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Chd1P40201 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms