Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms