Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprkP35822 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprkP35822 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprkP35822 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprkP35822 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PtprkP35822 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms