Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin1P35438 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms