Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Grin2aP35436 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms