Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms