Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pola1P33609 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pola1P33609 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pola1P33609 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms