Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms