Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BgnP28653 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BgnP28653 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BgnP28653 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BgnP28653 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BgnP28653 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms