Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms