Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgfb2P27090 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgfb2P27090 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms