Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk11bP24788 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms