Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms