Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkchP23298 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkchP23298 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkchP23298 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkchP23298 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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