Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms