Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VimP20152 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
VimP20152 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VimP20152 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VimP20152 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VimP20152 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VimP20152 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VimP20152 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VimP20152 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VimP20152 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VimP20152 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VimP20152 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VimP20152 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VimP20152 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VimP20152 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VimP20152 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VimP20152 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms